Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IGSF9BQ9UPX0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms