Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRAK1Q9UPV9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRAK1Q9UPV9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms