Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
L1RE1Q9UN81 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms