Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
USP18Q9UMW8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
USP18Q9UMW8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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