Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VANGL2Q9ULK5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
VANGL2Q9ULK5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms