Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FBXO4Q9UKT5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms