Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CDC42EP3Q9UKI2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms