Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms