Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS0

RPS6KB2, Ribosomal protein S6 kinase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB2Q9UBS0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPS6KB2Q9UBS0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms