Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD2Q9UBB5 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MBD2Q9UBB5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms