Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL42Q9P2K6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms