Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf78Q9NZ63 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms