Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRMT1Q9NXH9 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms