Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK13-1Q9NX77 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ERVK13-1Q9NX77 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms