Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RHBDL2Q9NX52 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms