Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRC4BQ9NT99 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms