Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF275Q9NSD4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms