Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDHB16Q9NRJ7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDHB16Q9NRJ7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDHB16Q9NRJ7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCDHB16Q9NRJ7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCDHB16Q9NRJ7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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