Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GPHNQ9NQX3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms