Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A4GALTQ9NPC4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A4GALTQ9NPC4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms