Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRRN3Q9H3W5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LRRN3Q9H3W5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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