Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SHARPINQ9H0F6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms