Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFDQ9GZP0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFDQ9GZP0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms