Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KLHL4Q9C0H6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms