Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNPKQ9C0E8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNPKQ9C0E8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms