Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NMES1Q9C002 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms