Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC8Q9BY41 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms