Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAPERQ9BY12 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms