Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CARD11Q9BXL7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms