Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NUP58Q9BVL2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NUP58Q9BVL2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms