Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PI4K2AQ9BTU6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms