Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MYD88Q99836 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MYD88Q99836 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms