Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NPAS2Q99743 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms