Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PITX2Q99697 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms