Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SIN3AQ96ST3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms