Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALS2Q96Q42 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALS2Q96Q42 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms