Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TSNARE1Q96NA8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSNARE1Q96NA8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms