Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms