Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LINC00208Q96KT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LINC00208Q96KT6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms