Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPNQ96H22 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms