Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TIMD4Q96H15 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms