Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
OTUB1Q96FW1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms