Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MFSD3Q96ES6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms