Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MALSU1Q96EH3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms