Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NMD3Q96D46 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NMD3Q96D46 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms