Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC59Q96AG4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms