Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-CQ95604 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms