Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
USP9XQ93008 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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