Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PRG4Q92954 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PRG4Q92954 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms