Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
UBXN4Q92575 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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UBXN4Q92575 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
UBXN4Q92575 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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